A igreja de São Salvador da Sé é um imponente templo maneirista de arquitetura chã portuguesa, mandado construir em 1568 pelo Cardeal D. Henrique. A sua construção pretendia oferecer à Diocese de Angra, criada a 3 de novembro de 1534, uma nova sede de bispado, substituindo a pequena igreja dedicada a São Salvador, construída no início do povoamento de Angra, que se entendeu ser demasiado modesta para essa função.
A 18 de novembro de 1570 deu-se início à construção da nova catedral, expandindo-se a primitiva igreja, com projeto original de Luís Gonçalves. A obra levou 48 anos a ser terminada, com pelo menos um período de interrupção nos finais do século XVI, durante o conflito da crise dinástica.
O edifício da Sé foi profundamente danificado pelo sismo de 1 de janeiro de 1980, pelo desabamento da fachada a 5 de julho de 1983 e pelo incêndio de 23 de setembro de 1983, levando à perda de um enorme espólio artístico, principalmente de decoração barroca. A 11 de junho de 1980 o Governo Regional dos Açores classificou a Catedral de São Salvador como Monumento Regional.